姓名:倪挺
职称:教授
职务:院长助理
电子邮箱:tingni@fudan.edu.cn
办公地点:复旦江湾校区生命科学大楼E601-9室
办公电话:021-31246627
研究方向
细胞衰老及癌变的转录组调控
个人简介
男,1977年出生,博士,研究员,博士生导师。2000年获北京大学生命科学学院生物化学及分子生物学系学士学位,2000-2006年硕博连读于北京大学生命科学学院并于2007年获植物学博士学位。2007-2010年在美国杜克大学基因组科学与政策研究所从事博士后研究。2010-2012年在美国国立卫生研究院(NIH)担任助理研究员(Research Fellow)。2012年受聘为bv伟德国际体育研究员。在Science、Nature、Nature Methods、Genome Research、Nucleic Acids Research、Aging Cell等杂志发表研究论文近50篇。目前以细胞衰老及癌变为研究体系,结合高通量测序、分子生物学、细胞生物学和生物信息学等手段研究复杂而多样化的转录组调控,特别是内含子保留和选择性多聚腺苷酸化这两种RNA加工成熟过程调控手段的功能、机制及生物学意义。先后主持国家科技部973计划课题和重点研发计划课题各1项、国家基金委重大研究计划培育项目1项及面上项目3项。
授课情况
参与主讲本科生课程《现代生物科学导论》、《基因组学》
参与主讲研究生课程《基因组学》、《书报讨论(人类生物学)》、《研究生实验与仪器分析-遗传模块》,参与组织和讲授《现代生物学基础与前沿II-遗传和发育生物学》
招生专业
遗传学-人类和医学分子遗传学、生物信息学-疾病遗传信息分析
代表性论文和论著
1. Chen, Meng#; Wei, Ran#; Wei, Gang; Xu, Mingqing; Su, Zhixi*; Zhao, Chen*; Ni, Ting*. Systematic evaluation of the effect of polyadenylation signal variants on the expression of disease-associated genes. Genome Research, 2021, DOI: 10.1101/gr.270256.120.
2. Wang, Weixu; Tan, Huanhuan; Sun, Mingwan; Han, Yiqing; Chen, Wei; Qiu, Shengnu; Zheng, Ke*; Wei, Gang*; Ni, Ting*. Independent component analysis based gene co-expression network inference (ICAnet) to decipher functional modules for better single-cell clustering and batch integration. Nucleic Acids Research, 2021, gkab089: DOI: 10.1093/nar/gkab089.
3. Ding, Dong#; Yao, Jun#; Li, Xueping; Shen, Ting; Fu, Haihui; Zhong, Hua; Wei, Gang*; Ni, Ting*. Prevalent intron retention fine-tunes gene expression and contributes to cellular senescence. Aging Cell, 2020, 19(12): e13276.
4. Chen, Meng#; Lyu, Guoliang#; Han, Miao#; Nie, Hongbo#; Shen, Ting; Chen, Wei; Niu, Yichi; Song, Yifan; Li, Xueping; Li, Huan; Chen, Xinyu; Wang, Ziyue; Xia, Zheng; Li, Wei; Tian, Xiao-Li; Ding, Chen; Gu, Jun; Zheng, Yufang; Liu, Xinhua; Hu, Jinfeng; Wei, Gang*; Tao, Wei*; Ni, Ting*. 3' UTR lengthening as a novel mechanism in regulating cellular senescence. Genome Research, 2018, 28(3): 285-294.
5. Ni, Ting#*; Yang, Wenjing#; Han, Miao#; Zhang, Yubo; Shen, Ting; Nie, Hongbo; Zhou, Zhihui; Dai, Yalei; Yang, Yanqin; Liu, Poching; Cui, Kairong; Zeng, Zhouhao; Tian, Yi; Zhou, Bin; Wei, Gang; Zhao, Keji; Peng, Weiqun*; Zhu, Jun*. Global intron retention mediated gene regulation during CD4(+) T cell activation. Nucleic Acids Research, 2016, 44(14): 6817-6829.